28. RNAi in C. elegans, of hoe bepaal je de functie van een gen?
Algemene info
Het scientists@work onderzoeksproject kadert in Devgen’s breder C. elegans genoom onderzoeksproject waarin de functie van elk individueel gen van deze bodemnematode onderzocht wordt. Al zien mens en worm er nogal verschillend uit, vanuit genetisch oogpunt zijn ze toch vrij gelijkend. Door de genen van dit modelorganisme te bestuderen proberen we meer te weten te komen over de functie van de genen bij de mens.
In het erfelijk materiaal, of DNA, liggen de genen gecodeerd als opeenvolging van 4 bouwstenen: A, C, G en T.
Een gen bevat de informatie om een eiwit te produceren. RNA, een boodschapper molecule, speelt hierin een belangrijke rol. De geproduceerde eiwitten zijn op hun beurt de moleculaire machines van de cel die allerlei taken uitvoeren. Denk maar aan de vele enzymes die we aanmaken.
Pakweg 7 jaar terug werd de opeenvolging van bouwstenen in het erfelijk materiaal van C. elegans volledig ontrafeld. Een schat aan informatie ligt verborgen in dit boek van 100 miljoen opeenvolgende letters van A, C, G en T. Berekeningen voorspellen wel 20.000 genen in het genoom van deze worm.
Een manier om de functie van een bepaald gen te weten te komen is ervoor te zorgen dat het overeenkomstige eiwit niet meer wordt aangemaakt en de gevolgen hiervan te bestuderen. RNAi of ‘RNA interference’ is een recente technologie die in staat is om de boodschapper moleculen van een gen, het RNA, uit te schakelen. Bij gevolg leidt RNAi er toe dat het overeenkomstige eiwit van dat gen niet meer wordt aangemaakt. C. elegans is uitermate geschikt om de gevolgen hiervan te observeren.
Omschrijving
De leerlingen zullen als onderdeel van de RNAi_technologie een circulair DNA moeten isoleren uit een bacteriecultuur. Daarna zullen ze dit circulair DNA in 2 stukjes knippen in een proefbuis. De stukjes zullen geanalyseerd en zichtbaar gemaakt worden via DNA-elektroforese.
Begeleiders
Bert Oosthuyse, Wim Ornelis
Plaats
Devgen
Technologiepark 30
9052 Zwijnaarde
|